Deze keuze wordt gemaakt op basis van vooraf vastgestelde criteria. Zodra een onderwerp is gekozen, wordt dit gedeeld met de gemeenteraad en met de bewoners van Deventer via een nieuwsbericht. Daarna wordt een plan voor het onderzoek opgesteld en naar de gemeenteraad gestuurd. Dan begint het onderzoek.

De Rekenkamer kan zelf het onderzoek uitvoeren of een extern bureau inschakelen. Dit hangt af van wat nodig is om een goed onderzoek te garanderen. De resultaten en aanbevelingen komen in een rapport dat aan de gemeenteraad wordt aangeboden. Ook dit wordt weer met een nieuwsbericht gedeeld met de inwoners van Deventer. De Rekenkamer neemt geen politieke standpunten in, maar geeft adviezen en oplossingen om de gemeente te helpen verbeteren.

De rapporten van de Rekenkamer zijn openbaar, maar soms kan een deel van het rapport geheim blijven volgens de Wet Open Overheid.